Gene enrichment sada pro základní a aplikovaný výzkum role mutací v lidském genu BRCA2
- tato sada 100 sond o délce 120 nt je založena na proprietární technologii xGen Lockdown Probe od společnosti Integrated DNA Technologies Inc.
- funkce produktu: směs sond lze využít k nabohacení genomových fragmentů genu BRCA2 ve vzorku lidské genomové DNA před cíleným resekvenováním metodami sekvenování nové generace
- pro další informace viz také následující prezentaci
- sondy pokrývají následujících 26 exonů transkriptu NM_000059 (identický s U43746), k zajištění dokonalého pokrytí byl pro designování každý exon prodloužen o +50 nt na každé straně (udané kóty odpovídají hg19 verzi lidského genomu):
NM_000059_0 | chr13 | 32890548-32890714 |
NM_000059_1 | chr13 | 32893164-32893512 |
NM_000059_2 | chr13 | 32899163-32899371 |
NM_000059_3 | chr13 | 32900188-32900337 |
NM_000059_4 | chr13 | 32900329-32900469 |
NM_000059_5 | chr13 | 32900586-32900800 |
NM_000059_6 | chr13 | 32903530-32903679 |
NM_000059_7 | chr13 | 32905006-32905217 |
NM_000059_8 | chr13 | 32906359-32907574 |
NM_000059_9 | chr13 | 32910352-32915383 |
NM_000059_10 | chr13 | 32918645-32918840 |
NM_000059_11 | chr13 | 32920914-32921083 |
NM_000059_12 | chr13 | 32928948-32929475 |
NM_000059_13 | chr13 | 32930515-32930796 |
NM_000059_14 | chr13 | 32931829-32932116 |
NM_000059_15 | chr13 | 32936610-32936880 |
NM_000059_16 | chr13 | 32937266-32937720 |
NM_000059_17 | chr13 | 32944489-32944744 |
NM_000059_18 | chr13 | 32945043-32945287 |
NM_000059_19 | chr13 | 32950757-32950978 |
NM_000059_20 | chr13 | 32953404-32953702 |
NM_000059_21 | chr13 | 32953837-32954100 |
NM_000059_22 | chr13 | 32954094-32954332 |
NM_000059_23 | chr13 | 32968776-32969120 |
NM_000059_24 | chr13 | 32970985-32971231 |
NM_000059_25 | chr13 | 32972249-32972957 |
- co produkt obsahuje: ekvimolární směs všech 100 sond v celkovém množství dle zvolené škály (2/20/200 pikomolů), všechny sondy mají biotinovou modifikaci na 5' konci
- cena: je dostupná na stránkách obchodní divize společnosti KRD s.r.o, je to standardní zákaznická cena za směs libovolných sond xGen Lockdown Probe
- jak se produkt používá: hybridizace probíhá vsádkovou metodou ve zkumavách, za použití streptavidinových kuliček, hybridizační protokoly jsou k dispozici na vyžádání, postup je schematicky znázorněn níže
- doba dodání: 9-12 dnů
- kontrola kvality: každá sonda je samostatně syntetizována a spektrofotometricky kontrolována
Reference:
1. Nat Methods. 2010 Feb;7(2):111-8. doi: 10.1038/nmeth.1419. Review.
2. Nat Methods. 2010 Nov;7(11):913-5. doi: 10.1038/nmeth.1516. Epub 2010 Oct 17.
- tento produkt je v experimentální beta verzi, před klinickou validací